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A Multi-Species-Compatible Vi Sual Analytics Platform for Bulk, Single-Cell, and Spatial Rna-Seq Datasets

Project: National Science and Technology Council › National Science and Technology Council Academic Grants

Project Details

Abstract

本計畫旨在藉由建立免費且多物種相容的RNA分析平台，降低研究者在轉錄組數據處理與分析中的計算與技術門檻。透過提供GPU加速的高效分析流程及多物種細胞類型註釋框架，我們期望能支援更廣泛的生物學研究需求，尤其是在單細胞與空間轉錄組學等前沿領域。在社會層面，本計畫的免費應用程式與教育訓練將促進生物資訊技術的普及，為更多研究者和學術機構提供負擔得起的轉錄組學分析工具。在經濟層面，降低學習與分析成本將提高研究效率，並可能加速學術與產業間的技術轉移與合作，進而提升生物技術產業的創新能力。在學術層面，本計畫將透過定期舉辦的教育訓練，提升研究者對RNA定序數據分析的能力與信心，並透過持續的社群互動與軟體更新，促進科學交流與新知識的產生。 最終，我們期望本計畫能促進跨學科合作，加速科學突破，並為全球生物資訊與轉錄組學研究的進步做出貢獻。

Project IDs

Project ID:PB11407-13212
External Project ID:NSTC114-2221-E182-044
StatusActive
Effective start/end date01/08/25 → 31/07/26

Keywords

  • Single-cell sequencing
  • cell type annotation
  • spatial transcriptomics
  • GPU acceleration
  • gene co-expression analysis
  • gene set variation analysis
  • cell communication
  • multi-species
  • desktop application

Access Project