A Vi Rome Data Analysis Toolkit for Exploring the Phylodynamics of Emerging Vi Ruses

Project: National Science and Technology CouncilNational Science and Technology Council Academic Grants

Project Details

Abstract

自 2019 年 12 月起,新型冠狀病毒已於全球迅速傳播,截至2021年6月已感染約1.8億人,並導致 400 萬人死亡,針對未知病毒的流行病與演化過程提出新的見解無疑是有迫切的需要,由於基因組和親緣演化樹分析的不當應用將導致嚴重的錯誤解讀,以及公開數據庫雖然提供大量定序資料,但可能忽略其中與演化機制相關的資訊。本三年期計畫中,針對病毒組數據,將開發一套可持續發展且可再現的分析工具組,主要用於分析病毒組資料,提高對病毒演化與分子機制的理解,並應用深度學習模型加速偵測基因變異,以及即時解譯與可視化親緣動態學。本研究除了應用於新冠病毒,也可擴展到其他新興病毒,以因應未來全球與地區性所爆發的疫情。

Project IDs

Project ID:PB11010-6899
External Project ID:MOST110-2222-E182-004
StatusFinished
Effective start/end date01/09/2131/08/22

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