An Integrated Functional Genomic Approach to Characterizing the Transcriptional Role of EDD and Its Physiological Significance

Project: National Science and Technology CouncilNational Science and Technology Council Academic Grants

Project Details

Abstract

EDD 為一具有HECT 區位(domain)的細胞泛素E3 接合.,目前已知EDD 在哺乳細胞中參與細胞增生、基因轉錄調控和DNA 損傷等相關反應,然而,有關於EDD 調控細胞生長的正確機制仍有許多未知需探討。近來研究則發現EDD 在轉錄的調控上扮演一個重要但較少被探討到的功能。在此計劃書中,我們將整合一系列有系統的方法利用在探討EDD 在轉錄調控上的重要性,例如CHIP-CHIP 、microarray 以及TF-TF 陣列分析。首先,使用染色質免疫沉澱法及配合基因表現數據,在整個基因組內廣泛的找尋EDD 在轉錄調控上的標的基因。接著,利用探討與EDD 結合的轉錄共同調節子,以及EDD 標的位置的染色質調控,都有助我們探討EDD 所架構起的轉錄調控分子機制。最後,EDD 在轉錄上調控所扮演的生理意義則可以藉由探討在1)腫瘤形成以及2)果蠅胚胎發育這兩種過程中,這樣的轉錄調控網是否受到改變,以及EDD 標的基因與腫瘤或發育的相關性。在此計劃書所建立的研究系統,將有利於我們更瞭解EDD 在轉錄調控上的功能及分子機制,更進一步的將基因表現調控(或者錯誤的調控)以及細胞生長與分化作一個連結。

Project IDs

Project ID:PC9607-0114
External Project ID:NSC96-2320-B182-010
StatusFinished
Effective start/end date01/05/0731/07/08

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