Expressed Sequence Tags Clustering and Single Nucleotide Polymorphisms Identification Using Hidden Markov Models

Project: National Science and Technology CouncilNational Science and Technology Council Academic Grants

Project Details

Abstract

世界各地研究中心所產生的大量基因表達序列標籤 (ESTs)及單核.酸基因多型性 (SNPs)的資料,正以不可思議的速度累積,這兩個資料庫在短短的時間內已經擴充超過百倍。在人類基因圖譜發表之後,基因研究的重心已經轉移至尋找genetic markers及clinical phenotypes之間的關係,藉由此關係希望能找到對抗疾病的有效治療方法。因此急需找到一種自動程序能夠精確的確認及分類解碼的基因序列。本研究計畫利用隱藏式馬可夫模型提出一個比起現在使用的方法更精確、更高效率且自動化的方法來分類以及叢集 (clustering)大量基因表達序列標籤的定序及尋找單一核甘酸多型性的資料。本研究計畫預期能夠達到確認同基因多型性 (isoforms),以及從分類的基本圖案中分辨出基因家族。本計畫的成功將有助於將來癌症的研究。

Project IDs

Project ID:PB9308-2759
External Project ID:NSC93-2213-E182-011
StatusFinished
Effective start/end date01/08/0431/07/05

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