Learning from Peta-Scale High-Throughput Sequencing Data to Explore the Genotypic and Phenotypic Dynamics of Emerging Viruses

Project: National Science and Technology CouncilNational Science and Technology Council Academic Grants

Project Details

Abstract

自2019年12月起,新型冠狀病毒已於全球迅速傳播,截至2021年12月已感染約2.8億人,並導致五百萬人死亡,雖然公開資料庫已提供了大量基因序列,但是如何藉由分析病毒基因序列資料連結並解釋臨床表型特徵仍然還有一段距離。於本三年期計畫中,將元資料與表型資料結合於病毒親緣關係樹的分析中,以研究病毒的進化過程,進一步重塑親緣演化樹,並在千兆規模高通量資料中應用深度學習模型,期許從資料中學習探索新興病毒的演化和表型全貌。面對新冠病毒疫情持續爆發,本研究針對該病毒將提供一套可持續性和可重複性的生物資訊分析工具組與流程,未來也可將擴展到其他新興病毒,以對抗未知病毒所造成的疫情爆發。

Project IDs

Project ID:PB11107-7120
External Project ID:MOST111-2221-E182-053-MY3
StatusFinished
Effective start/end date01/08/2231/07/23

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