Project Details
Abstract
腸病毒是一個高度傳染的病原體,常造成大小不一的疫情,症狀可嚴重至死亡,而且好發於嬰幼兒及學童。除了其毒性以外,腸病毒具有高度演化的能力,可以很容易的突變成新型病毒,造成未知的威脅。基因重組是演化上的一個重要機制,共同感染同一個宿主細胞的兩種或多種病毒可以透過重組彼此交換其基因碼,導致更多新型腸病毒的出現。經由機器學習這種新技術的加入,我們可以對眾多種腸病毒之基因碼做分類,並且預測出某一個病毒基因組是否有重組,以及其組合成分之源頭病毒。執行本計畫可以對現有的腸病毒基因資料庫做更完整的註解,讓研究者能針對重組腸病毒的基因特性有更完整的認識,有助於發展相關的分子檢驗技術、疾病診斷、流行病學研究等。
Project IDs
Project ID:PB11008-0230
External Project ID:MOST109-2221-E182-043-MY2
External Project ID:MOST109-2221-E182-043-MY2
Status | Finished |
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Effective start/end date | 01/08/21 → 31/07/22 |
Keywords
- enterovirus
- species
- multiple sequence alignment
- classification
- deep learning
- recombination
- benchmark
Fingerprint
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