The Integration of Cluster Analysis and Association Rule Mining for Mining Gene Regulation Relation

Project: National Science and Technology CouncilNational Science and Technology Council Academic Grants

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Abstract

日前,人類基因體計劃終於完成了基因體排序的最終決定版,儘管基因體序列解碼帶給基礎生物醫學研究很大的進展,然而有了基因序列資料卻無法完全掌握其表現出來的功能與結構,且無法清楚瞭解細胞中基因所扮演的角色以及對特定生物的調控,甚至跟致病機轉的關係為何。因而,從基因的角度出發,瞭解基因的基本功能,便成為後基因體時代中實現基因體醫學的重要課題之一。目前,基因微陣列晶片技術的使用,有助於個別基因表現量的定量分析,基因微陣列晶片具備快速、方便、經濟、省時等特性,適用於大量基因表現的篩檢及比對等研究,因此生物醫學研究者可經由實驗藉此產生大量的基因表現資料,分析後可幫助瞭解基因的調控或者是基因與疾病之間的複雜關係。在此研究中,我們希望整合資料探勘技術中的叢集分析與關聯法則探勘技術,藉由使用酵母菌的基因表現時間序列資料,來建立一套有效的方法以分析基因的單一調控、複調控以及基因的多重功能。基因在特定條件下的單一調控一般常用叢集分析技術來分析,然而,基因複調控與基因多重功能的分析則較難,目前仍缺乏有效的分析方式,因此本研究探索發展一套這樣系統化的方式。

Project IDs

Project ID:PB9408-3264
External Project ID:NSC94-2213-E182-022
StatusFinished
Effective start/end date01/08/0531/07/06

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