探索新興病毒親緣動態學之病毒組資料分析工具組

研究計畫: 國家科學及技術委員會(原科技部) 國家科學及技術委員會學術補助

研究計畫-專案詳細資料

摘要

自 2019 年 12 月起,新型冠狀病毒已於全球迅速傳播,截至2021年6月已感染約1.8億人,並導致 400 萬人死亡,針對未知病毒的流行病與演化過程提出新的見解無疑是有迫切的需要,由於基因組和親緣演化樹分析的不當應用將導致嚴重的錯誤解讀,以及公開數據庫雖然提供大量定序資料,但可能忽略其中與演化機制相關的資訊。本三年期計畫中,針對病毒組數據,將開發一套可持續發展且可再現的分析工具組,主要用於分析病毒組資料,提高對病毒演化與分子機制的理解,並應用深度學習模型加速偵測基因變異,以及即時解譯與可視化親緣動態學。本研究除了應用於新冠病毒,也可擴展到其他新興病毒,以因應未來全球與地區性所爆發的疫情。

Project IDs

系統編號:PB11010-6899
原計畫編號:MOST110-2222-E182-004
狀態已完成
有效的開始/結束日期01/09/2131/08/22

Keywords

  • 資訊科學--軟體
  • 冠狀病毒
  • 嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型
  • 病毒組
  • 高通量定序
  • 親緣動態學
  • 遺傳多樣性
  • 插入缺失標記
  • 基因重組
  • 深度學習
  • 再現性

指紋

探索此研究計畫-專案觸及的研究主題。這些標籤是根據基礎獎勵/補助款而產生。共同形成了獨特的指紋。