連結基因體、蛋白質體、代謝體之分子改變探討口腔癌致病機轉與轉譯醫學應用(I)

口腔癌是國人重大癌症之一，近年來，每年的發生率仍持續升高；而且雖然 醫療方法顯著提升進步，但死亡率並未相對的減少。總計劃主持人長庚大學張玉 生特聘教授及相關領域專業之教師組成團隊，共同執行此口腔癌之整合型體學研 究，期望能找出癌症生物標記，可作為早期診測、治療追蹤，甚至協助治療之指 標。口腔癌與其他癌症相似，個體之間具差異性，在基因DNA變異，基因及蛋 白質表現，甚至代謝物質均可能不盡相同。為了進一步了解口腔癌基因變異-RNA 表現-蛋白質表現之直接關聯，在這三年計劃，我們擬在同一口腔癌檢體進行全 基因體DNA變異分析（exome sequencing)及RNA表現/變異分析（RNA seq) (Subproject II:張玉生教授/譚賢明副教授/劉軒助理教授級研究員），蛋白質變化 (Proteome profiling 及 targeted MRM 分析）（Subproject III:陳怡婷助理教授/余 兆松教授)。由以上數據，我們將建立在每一個口腔癌檢體各層級分子之關聯性，並探討可能影響代謝物生成之pathway，進行相關特定代謝物之分析(Subproject IV:吳治慶助理教授）。張凱評教授則主持Subproject I，將收集300名口腔癌病 患及300名健康志願者的唾液與血液樣本，及這300名口腔癌病患在手術切除後 的剩餘組織檢體。從基因體DNA變異、RNA表現，蛋白質表現至pathway分 析等整體之生物資訊平台將由鄧致剛副教授及黃柏榕助理教授及研究員 (Subproject V)建立並執行。由此我們更能進一步建立口腔癌癌化的主要生物機制， 釐清致癌機制與癌症之分子變異之相關性，以及建立重要變異分子作為生物標記 之學理基礎及可行性。本計劃之最終目標為建立適用於口腔癌早期診測、治療藥 物選擇、預後評估之分子標記組，同時也可系統性研究口腔癌之致癌機制。

系統編號:PC10309-0063
原計畫編號:MOST103-2632-B182-001