研究計畫-專案詳細資料
摘要
近幾年來，越來越多的次世代定序技術被提出，如Roche 454、Illumina Solexa以及ABI SOLiD，這些技術的特點就在於能在短時間內產生大量的短片段生物序列，且能用於產生去氧核醣核酸、核醣核酸以及非編碼核醣核酸序列，透過這些序列的產生，我們可以進行基因體序列的組序、基因的預測以及癌症分析等工作，但由於龐大的短片段生物序列，過去生物資訊領域所開發的工具並不能完全適用於這類的定序資料，因此，整合性計畫的目的在於發展一個高通量定序的分析平台，該平台將提供從定序、功能分析到基因網路分析所需要的技術及工具，而本子計畫的目標就在於針對次世代定序技術所產生的核醣核酸片段進行一系列樣式比對技術的開發工作，並將所開發的技術應用於基因預測的研究課題上。以下將簡述各年的目標:第一年: 研發適合於次世代定序技術所產生的RNA片段之精確與近似樣式比對技術(著眼於序列的前處理、速度及精確度)、研發樣式比對技術來解決分裂問題、研發在單圖形處理器環境的樣式比對技術。第二年: 研發使用EST資料庫註解資訊的樣式比對技術、應用樣式比對技術於單物種的基因預測問題、研發在多圖形處理器環境的樣式比對技術。第三年: 研發樣式比對技術來解決比較基因體常見的問題、應用樣式比對技術於多物種的基因預測問題、研發在圖形處理器叢集系統環境的樣式比對技術。
Project IDs
系統編號:PB10202-0718
原計畫編號:NSC100-2221-E182-057-MY3
原計畫編號:NSC100-2221-E182-057-MY3
| 狀態 | 已完成 |
|---|---|
| 有效的開始/結束日期 | 01/08/13 → 31/07/14 |
Keywords
- 資訊科學--軟體
- 生物技術(理)
- 生物資訊
- 次世代定序技術
- 樣式比對
- 圖形處理器
- 平行處理
指紋
探索此研究計畫-專案觸及的研究主題。這些標籤是根據基礎獎勵/補助款而產生。共同形成了獨特的指紋。