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隱藏式馬可夫模型用於大量基因表達序列標籤的叢集及單核甘酸基因多型性識別

研究計畫: 國家科學及技術委員會(原科技部) 國家科學及技術委員會學術補助

研究計畫-專案詳細資料

摘要

世界各地研究中心所產生的大量基因表達序列標籤 (ESTs)及單核.酸基因多型性 (SNPs)的資料,正以不可思議的速度累積,這兩個資料庫在短短的時間內已經擴充超過百倍。在人類基因圖譜發表之後,基因研究的重心已經轉移至尋找genetic markers及clinical phenotypes之間的關係,藉由此關係希望能找到對抗疾病的有效治療方法。因此急需找到一種自動程序能夠精確的確認及分類解碼的基因序列。本研究計畫利用隱藏式馬可夫模型提出一個比起現在使用的方法更精確、更高效率且自動化的方法來分類以及叢集 (clustering)大量基因表達序列標籤的定序及尋找單一核甘酸多型性的資料。本研究計畫預期能夠達到確認同基因多型性 (isoforms),以及從分類的基本圖案中分辨出基因家族。本計畫的成功將有助於將來癌症的研究。

Project IDs

系統編號:PB9308-2759
原計畫編號:NSC93-2213-E182-011
狀態已完成
有效的開始/結束日期01/08/0431/07/05

Keywords

  • 資訊科學--軟體
  • 大量基因表達序列標籤
  • 單一核甘酸多型性
  • 叢集分析
  • 排列定序
  • 基本圖案
  • 隱藏式馬可夫模型
  • 生物資訊以及基因排序的問題

指紋

探索此研究計畫-專案觸及的研究主題。這些標籤是根據基礎獎勵/補助款而產生。共同形成了獨特的指紋。