全基因體特性分析Pinin 蛋白質對於骨骼肌細胞分化時基因轉錄所扮演的角色

轉錄體學是研究單一細胞內各種形式 RNA 表現的方法，藉著研究轉錄體學可了解細胞內 RNA 在特定生理或發育期時的變化。雖然過去的研究對於轉錄或後轉錄的機制有深入探討，但全基因體的轉錄體學研究仍然著墨不多，而近年來廣泛使用的全轉錄體深層序列分析促進了 RNA 轉錄學的發展，達到全基因體定量的水平。本計劃的總體目標欲探討 pinin (pnn) 蛋白質在骨骼肌生長時所扮演的轉錄調控角色。pnn 是一個位於細胞核斑且是細胞內不可或缺的蛋白質，然而其在特定組織中所調控的下游基因及調控機轉並不清楚。本計劃因此將建立一完整分析 pnn 轉錄功能的全基因體分析方法從而控討下列有關 pnn 與轉錄體有密切關系的2大課題: (1)pnn 調控轉錄體的分子機制;(2)pnn 的轉錄調控在骨骼肌生長發育所扮演角色。首先我們利用全基因體分所的方式，如 RIP-Seq，chIP-Seq 去搜尋並分析分化的骨骼肌細胞中 pnn 的目標基因及 RNA(計劃目標1)。我們也會探討 pnn 目標基因被其調控的分子機制，其中也包含與啟動子相關的組蛋白調控(計劃目標2)。最後我們將制作並利用剔除 pnn 的條件式基因剔除鼠來全盤探討並証實從骨骼肌細胞中得來的體外實驗數據(計劃目標3)。動物實驗的結果也可填補細胞培養和活體實驗結果的差異，讓我們更清楚的了解 pnn 在骨骼肌生長發育中所扮演的轉錄調控角色。藉著本計劃整體性的全基因體方式探討，我們對於 pnn 在 RNA 調控的功能將有通盤式的了解。

系統編號:PC10408-1260
原計畫編號:MOST104-2320-B182-011-MY3