利用肺組織與肋膜積液定量蛋白體鑑定與分析和非小細胞肺癌轉移相關的蛋白質標記

研究計畫: 國家科學及技術委員會(原科技部) 國家科學及技術委員會學術補助

研究計畫-專案詳細資料

摘要

肺癌是世界上最常見的癌症之一,在台灣則是造成癌症死亡最主要的原因,其中以非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer) 為最常見的肺癌種類,約佔 80% 的肺癌案例。腫瘤的期別 (stage) 是決定病患預後的最主要因素,癌細胞轉移至縱膈腔淋巴結 (lymph node, N),甚至遠處轉移 (distantmetastasis, M) 則決定肺癌期別與癌細胞惡性度的臨床表現,同時也影響最佳治療策略的選擇。然而,由於目前臨床診斷工具的使用效益有限,所以過去十年內,即便肺癌的治療策略已有明顯改善,但診斷與預後的應用發展仍有待加強。為了找尋並探究與癌症轉移相關的生物指標蛋白質(metastasis-related biomarker),本計劃將運用定量蛋白體學技術,建立來自肺腫瘤組織 (lung tissue) 以及肋膜積液 (pleural effusion) 的定量蛋白質資料庫。首先,我們將分析淋巴轉移程度不同 (N0, N1, N2以及M1) 的差異性表現肺癌組織蛋白體 (tissue proteome) 與磷酸蛋白體 (phosphoproteome),依照蛋白質的生物功能,文獻收尋與癌化的相關性,評估擔任肺癌生物指標蛋白質的新穎性等,篩選出與腫瘤轉移及分期相關的候選蛋白質。此外,為了找尋臨床應用價值高的體液生物指標蛋白質 (body fluidaccessible biomarkers),我們也將此肺癌組織蛋白體結合不同成因的肋膜積液蛋白體 (惡性與非惡性;肺癌與非肺癌) 以及肺癌細胞株分泌蛋白體 (secretome) 來篩選候選蛋白質。接著,我們將利用免疫組織染色、酵素連結免疫分析法與西方點墨法驗證與轉移相關的生物指標蛋白質之臨床重要性。我們也將運用分子生物學、細胞生物學、定量蛋白體學與生物資訊學等技術在肺癌細胞株與異種移植的老鼠模式中 (xenograft mice model),進行其功能性研究,以探討其分子調節機轉。本計劃將是首次運用差異性的肺癌組織蛋白體、不同成因的肋膜積液蛋白體與分泌蛋白體,共同來找尋與肺癌轉移相關的生物指標蛋白質的研究。我們希望藉由尋找與轉移相關的生物指標蛋白質用以評估肺癌病人的治療與預後外,也希望能為未來肺癌治療找尋新的方向。我們的研究目標是:1. 建立與肺癌轉移相關的生物指標蛋白質資料庫。a. 運用定量蛋白體技術鑑定轉移程度不同之肺癌組織的蛋白體/磷酸蛋白體,以建立與轉移相關的蛋白體組態。b. 運用定量蛋白體技術鑑定六種成因不同的肋膜積液蛋白體 (肺癌惡性與類惡性肋膜積液,二種非肺癌惡性肋膜積液,細菌性肺炎、結核性肺炎) 以建立與癌症惡性相關並可在體液偵測到的指標蛋白質資料庫。2. 開發可應用於肺癌預後的生物指標蛋白質組。a. 利用生物資訊軟體與文獻搜尋,分析肺腫瘤組織的差異性蛋白體/磷酸蛋白體所參與的重要訊息調節路徑與交互作用網路。b. 整合以上差異性的肺組織蛋白體,肋膜積液蛋白體以及癌細胞株分泌蛋白體,找尋來自於肺癌細胞、與轉移有關又可以在體液偵測到的指標蛋白質。c. 依照蛋白質的生物功能,與癌化的相關性,擔任肺癌標誌分子的新穎性等條件,篩選具有發展潛力的候選蛋白質。d. 利用肺癌組織、血清及肋膜積液驗證候選蛋白質的表現量與臨床分期,預後,死亡等相關性。3. 研究重要指標蛋白質的分子機轉。a. 運用肺癌細胞株與異種移植老鼠探討與肺癌轉移相關標的蛋白質的致病機轉。b. 驗証關鍵生物指標蛋白質 (promising biomarker) 和已知與轉移相關分子間 (well-knownsignaling molecules) 的關連性。c. 利用蛋白體學技術,系統性的分析關鍵生物指標蛋白質可能參與的新穎 (novel) 分子調節機轉與交互作用網絡。

Project IDs

系統編號:PC10301-0904
原計畫編號:NSC101-2320-B182-035-MY3
狀態已完成
有效的開始/結束日期01/08/1431/07/15

Keywords

  • 基礎醫學
  • 生物技術(醫)
  • 非小細胞肺癌
  • 癌症轉移
  • 淋巴轉移
  • 肺癌組織蛋白體
  • 磷酸蛋白體
  • 肋膜積液
  • 生物指標蛋白質
  • 定量蛋白體學

指紋

探索此研究計畫-專案觸及的研究主題。這些標籤是根據基礎獎勵/補助款而產生。共同形成了獨特的指紋。