藉由研究病毒與宿主細胞時間以及空間上的交互作用以探討RNA病毒複製機制

近年來新興的和復發流行的病毒，特別是RNA病毒，對人類以及其他物種的危脅大為提升。儘管用於鑑定以及檢測新興病毒的技術迅速進步，但是對於病毒複製機轉的全面分析和瞭解在抗病毒藥物開發中仍有舉足輕重的作用。病毒的一個重要特性是只能在宿主細胞內完成複製週期，因此深入探討病毒與宿主細胞的的交互作用可以幫助瞭解病毒複製的基本原理。在這份研究計畫中，我們設計了一個研究平台，藉由代謝標記的方式來系統性的研究正單鏈RNA病毒的複製。由於只有正在複製的基因體可以被標記，因此這個研究平台將可以運用在所有能夠感染細胞的RNA病毒。全基因體標記是藉由在病毒複製過程中嵌入4-硫代尿苷酸來達成，因此可以專一性的在不同的複製過程時間點中將病毒RNA結合的蛋白複合物（vRNP）分離出來。除了釐清參與病毒複製過程中不同階段的vRNP蛋白質組成外，我們也會對宿主細胞對於病毒感染所產生的專一性反應進行研究。藉由代謝標記，我們將收集病毒感染後宿主細胞新生成的RNA，針對包括編碼RNA和非編碼RNA進行次世代定序，並探討它們在病毒複製中的重要性。最後，藉由沉降分離實驗以及原位雜交實驗，我們將進一步研究由代謝標記而發現的即時性RNP / RNA在感染細胞中的分布情形並與其參與的複製功能相結合。因此藉由這個研究平台，我們將可以一系列的探討新興病毒感染後在宿主細胞中時間以及空間上的特性以瞭解病毒複製的可能機制。

系統編號:PC10910-0006
原計畫編號:MOST109-2320-B182-045-MY2