運用高覆蓋度定量蛋白體分析平台探討β型干擾素之作用機制

干擾素-beta (IFN-β)是一種被用在各種癌症及病毒感染疾病之臨床藥物，但在我們先前的蛋白質體學研究中，我們發現口腔鱗狀上皮癌病人組織中，癌細胞高度表達IFN-β 的下游蛋白。我們也發現，以IFN-β 處理癌細胞會提高細胞之移行能力，因此我們進一步分析其蛋白體及磷酸化蛋白體之改變情形。初步發現除了典型的干擾素下游蛋白受到調節，尚有許多未知調控機制的蛋白亦發生表現量之變化。其中包含了數個E3 ligase 在表現量或磷酸化程度發生變化。這種蛋白降解之調控機制在干擾素的訊息傳遞中所扮演的角色甚少被探討。因此我們希望藉由系統性的蛋白質體學技術進行深入的研究。然而，現行定量蛋白質體分析平台中，在初期(發現期)所使用的分析策略再現性偏低，必須多次重複才能獲得較可信的結果，且其後果就是可採用的數據庫越來越小。因此在本計畫中我們將建立一個高覆蓋度、高可信度的蛋白質體分析流程，進行干擾素處理後細胞之蛋白體及磷酸化蛋白體分析，以勾勒出在時程上詳細的蛋白質表現之調控機制。再配合適當抑制劑的使用，以釐清該調控路徑的正確性及重要性。

系統編號:PC10108-0289
原計畫編號:NSC101-2320-B182-012