研究計畫-專案詳細資料
摘要
大規模癌症定序計劃如The Cancer Genome Atlas (TCGA)、Therapeutically ApplicableResearch to Generate Effective Treatments (TARGET) 和International Cancer GenomeConsortium (ICGC)目前已完成了上萬例來自數十種癌症樣本的臨床資料和定序結果收集，含括有基因體、表觀遺傳體學和轉錄體等。先前已發現癌症基因體內的拷貝數變化、體突變、轉錄體改變均參與在癌細胞生成或癌症轉移、惡化，然而只有少數研究對基因體跟轉錄體的關聯進行探討。在本計劃中我們將建立一套分析平台整合分析來自同一樣本的個體學資料，系統性地探討癌症基因體和轉錄體變異之間的關聯性。對基因體上拷貝數改變、體突變、表關體學改變與基因表現進行相關分析，探討體突變對於轉錄體表現圖譜和不同剪接異構物(splicing isoform)選擇的影響等。此分析平台將被套用在長庚定序完成的台灣口腔癌資料和開放資料庫，在獲得這些關聯性分析結果之後，我們將進一步比較各種癌症間存在的顯著關聯之異同並對當中顯著的基因體改變或轉錄體改變進行組合，找出可能具臨床應用價值的生物標誌組合。最後，所找到的關聯性資料將整合於資料庫內，建立成一個專為探討基因體上的改變與轉錄體變異關聯的資料庫。同時我們也會把分析步驟建立為一個網站服務平台，提供給其他基因體研究者使用，幫助其他研究者更進一步了解基因體與轉錄體之間關聯性。
Project IDs
系統編號:PA10608-0318
原計畫編號:MOST106-2311-B182-005
原計畫編號:MOST106-2311-B182-005
| 狀態 | 已完成 |
|---|---|
| 有效的開始/結束日期 | 01/07/17 → 30/06/18 |
Keywords
- 生物技術(理)
指紋
探索此研究計畫-專案觸及的研究主題。這些標籤是根據基礎獎勵/補助款而產生。共同形成了獨特的指紋。