D型肝炎病毒之RNA重組(I)

D 型肝炎病毒(Hepatitis delta virus, HDV)之基因體結構及複製方法上與一些植物病原體,如 viroid 類似。RNA 重組(RNA recombination)為RNA 病毒演化上一重要機制，也發生在viroid 上；雖然phylogenetic analysis 結果建議HDV 可進行RNA 重組，但在自然界或實驗系統中，HDV RNA 重組現象並未直接被證實過。依本實驗室先前發現及執行中國科會計畫 (NSC 92-2320-B-182-053-) 結果顯示：在HDV 多重基因型自然感染病例中可分析到HDV RNA 重組分子，其重組點( recombination junctions)亦被定位；不僅次於，二基因型RNA 共同轉染(RNA co-transfection)之細胞培養實驗系統也已成功建立完成，並正用於研究HDV 第一及IIb 基因型間全長基因體之RNA 重組遺傳圖譜（genetic recombination map）。基於這些研究成果，提出本二年研究計劃，以期能進一步瞭解HDV RNA 重組機制。研究目標分述如下：第一年提出假設: HDV RNA 重組頻率由二病毒間RNA 序列相似程度及複製能力二個因子決定:：RNA 序列相似程度越高及複製能力越強，RNA 重組頻率越高；反之，則低。實驗室有複製能力強的第一基因型義大利株及IIb 基因型cDNA clones、複製能力較弱的第一基因型美國株、及複製能力最弱的第二基因型cDNA clones。如下述兩兩對照，來證實本假說：1. 研究HDV 第一基因型義大利株及第二基因型間之RNA 重組特性(不同基因型間之HDV RNA 重組)。2. 研究第一基因型義大利株及美國株間之RNA重組特性(同基因型不同病毒株間之HDV RNA 重組)。3. 研究第一基因型帶不同點突變的同病毒株間(義大利株)之RNA 重組特性(同基因型同病毒株間之HDV RNA 重組)。第二年1. 綜合上年度資料，分析比較不同基因型及同基因型HDV 病毒株間RNA 重組特性之異同，提出進一步HDV RNA 重組機制假說。2. 分析HDV RNA 重組所需之RNA 結構。3. 綜合研究結果，探討經RNA 重組後產生的新種HDV 病毒之複製能力，以確立RNA 重組在HDV 演化上之重要性。

系統編號:PC9308-2048
原計畫編號:NSC93-2320-B182-025