開發生物資訊新工具去探索RNA病毒序列、結構、功能與演化--以流感病毒與腸病毒為應用模型-以序列比對技術為核心的RNA病毒研究

近幾年世界上出現了相當多的新興病毒，也造成相當大的危害，而這些新興病毒大部份都是屬於核糖核酸病毒，一般而言核糖核酸病毒的變異速率相較於去氧核糖核酸病毒來的快，以致於在相關技術的發展上顯得格外的重要，整合型計畫的目標就在於探索核糖核酸病毒序列、結構、功能與演化的關係，並以流行性感冒病毒與腸病毒做為目前的研究對象，而本子計畫的目標就在於希望利用序列比對的技術進行核糖核酸病毒的研究，並著重於序列與演化關係的探討，本子計畫將從事於新的多序列比對技術發展、病毒或宿主間的比較基因體研究、大量序列或全基因體的研究。以下將簡述各年的目標。第一年: 發展新的多序列比對技術，包含整合三條全序列比對的技術、三條區域序列比對技術、三條序列剖面比對技術，並使其適用於去氧核糖核酸、核糖核酸、胺基酸序列，並建立相關的網站供生物學家使用。第二年: 從事病毒間比較基因體研究，著重於病毒間序列同源、變異及演化關係，也將進行宿主間比較基因體來分析宿主間受體的同與異，這部份也將建立相關的網站供生物學家使用。第三年: 進行大量序列或全基因體的研究，發展平行化多序列比對技術、分支與結合技術，也進行若干假說的實驗，這年度也將針對比較基因體的結果建立相關的資料庫供生物學家使用。

系統編號:PB9801-2180
原計畫編號:NSC97-2221-E182-033-MY3